微小管のプロトフィラメント(protofilament)

ずっと書こうと思っていたことに、微小管のプロトフィラメント構造のことがありました。

なぜ書かなかったのかというと、自分の中でどうしてもまだしっくりこないところがあって、そのもやもやが解消されるまで書けないと感じていたからです。

そんなこんなで数ヶ月書かなかったのですが、今日から書くことにしました。決してもやもやが晴れたわけではないのですが。

さて、ちょうど１年前に、微小管のマイナス端にはガンマ・チューブリン(γ-tubulin)が存在していて、そこから微小管が重合していく、という微小管形成中心(microtubule organizing center; MTOC)としてのγーチューブリン複合体のことを書きました。

MTOCから形成された微小管はダイナミックに重合と脱重合を繰り返すわけですが、その微小管本体はどういう構造になっているのでしょうか。

微小管という細長い管をハサミかナイフかですぱっと切ってみた断面図を上から見ると、大ざっぱに言って、tubulinが13個並んで輪になっている構図に見えます（下の図を参照）。

αーチューブリンとβーチューブリンが交互に１直線に並んだものを１本の「プロトフィラメント」と定義して、「微小管は13本のプロトフィラメントから成る」というように言います。１本のプロトフィラメントを、チューブリンがたくさん連なった細長い「串団子」だとすると、串団子を13本あつめて１本の微小管ができるというイメージです。

ここで不思議なのは、基本的に生体内（細胞内）で形成される微小管はプロトフィラメントの本数が13であることが非常に多い、ということです。これは1970年代から知られていたことです(Tilney et al., J. Cell Biol., 59:267- (1973))。

ところが、生体内ではなく、試験管内でチューブリンの重合を起こすと、必ずしも13とはならないということが1979-1980年にかけて明らかにされてきました。つまり、13, 14, 15本のプロトフィラメントからなる微小管が混在する状況なので、細胞内には、13プロトフィラメントの微小管を選択的に作るような何らかの仕組みがあると考えられてきました。

Tim MitchisonとMarc Kirschnerのグループは、1985年に発表した論文の中で、微小管は中心体から形成されることによってプロトフィラメント13本になるのだ、ということを示しています(J Cell Biol., 100:1185- (1985))。なるほど、これは理にかなっているかもしれない、重要な発見です。

次回に続きます。

細胞生物学会大会（2011年6月）

来る６月下旬に、第６３回　日本細胞生物学会大会が開催されます。

以前書いたことがありますが、細胞生物学の分野の研究者が集まる学会です。もちろん微小管や細胞分裂も大きな話題のひとつです。
細胞生物が好きな人が多く集まるうえに、規模が巨大すぎる学会というわけでもなく、個人的にはすごく好きな学会です。

詳細は

http://www.aeplan.co.jp/jscb2011/

を参照してください。演題登録の受け付けが始まっております。

今年は６月２７日〜２９日、場所は北海道大学（札幌）というのも魅力的ですね。

とうぜん私も行きたいのですが、同じ時期にInternational Fission Yeast Meeting (国際分裂酵母ミーティング)という分裂酵母の学会もあるので、迷うところです。
１週間でもずれていたら両方行くのですが、まったく同じ日に重なっているので両立は出来ません。悩みどころです。

染色体ワークショップ

1/11-13の染色体ワークショップ（石川県　山代温泉）に参加してきました。

今回の学会でわたしが勝手に感じたキーワードは、「コンデンシン」でした。
コンデンシンは、現在は理化学研究所 基幹研究所（埼玉県和光市）に研究室を構える平野達也先生のグループが発見した染色体を凝集させるタンパク質のことです。細胞周期の間期では染色体は核内で凝縮してませんが、分裂期では（よく染色体の模式図が「X」の字の形に描写されているように）凝縮して染色体分配に備えます。分裂期が終わり間期に戻る際に、染色体は凝縮をやめて元に戻ります（脱凝縮）。この現象自体は昔からしられていましたが、この染色体凝縮を起こすタンパク質複合体として、平野先生のグループが1997年に発表したのが「コンデンシン」です。

コンデンシンはその発見以来、盛んに研究されてましたが、今回のワークショップでは特にコンデンシン研究の発表をする方が増えており、まさに「コンデンシンワールド」が展開されておりました。私は、平野先生がアメリカから帰国されたことで、日本のコンデンシン研究が爆発的に盛んになったのだという印象を受けました。こういう効果を生み出すっていうのは本当にすごいことだと思います。

京都大学 柳田充弘先生の情熱的な特別講演もあり、とても印象的なワークショップだったと思います。

現地は一面の雪景色で、わたしにとってはこれが今シーズンの初雪でした。東京はけっこう寒いのに全然雪が降りませんね。

海外パケットし放題 in インド

インドの携帯事情はとても良いという話をしました。日本からの旅行者にとっては、料金が気になるところです。それでも今はdocomoもSoftbankも(auも3月から)海外パケットし放題のプランがあるので、携帯はとりあえず料金を恐れることなくガンガン使えます。今回はSoftbank(iPhone)の海外パケットし放題を利用したのですが、特に事前申し込みも手続きも必要ないです。しかし特に何も設定できないのが逆に怖い。

純粋に、Softbankが提携するインドの携帯会社（キャリア）に繋げばいいだけ。注意すべきなのは、どのネットワークに接続するかです。現地に着くとiPhoneが自動でネットワークを探してくれるのですが、通常は複数のネットワークが自動検出されるので、どれかを選ぶことになります。そこで検出されるのは必ずしもパケットし放題のネットワークとは限りません。そういうキャリアのまま通信し続けると高額請求になります。

そこで、事前にパケットし放題のキャリアを確認しておいて(例えばVodafone INDIAとかAirtelとか)、それらのどれかを選ぶ必要があります。自分が接続したのがパケットし放題のネットワークか、それとも対象外のものかは、接続後にSoftbankから送られてくるSMSメールを読めば分かります。最初に接続したのが対象外のネットワークだったのですが、SMSのおかげで気づきました。

設定というような作業はこれだけ。本当にパケットし放題プランとして認識されているのか怖かったです。月額がある一定額を超えたら警告メールが来る設定にしてありますが、それでもやはり不安はあります。後日請求額をみて、結果的に海外パケットし放題が正しく機能していたことが分かりました。

ちなみに、私は5日間利用して、約21万円に相当するパケット通信をしましたが、パケットし放題が有効だったおかげで、実際の料金は7,000円程度でした。

次回は懲りずにインドの交通事情と寺院です。

本年もどうかよろしく

2011年もどうかよろしくお願いいたします。

今年はもう少し研究のこと、微小管のことを書きたいと思っています。できるだけ正確に、あるいはバランス良く書こうと思うと、完璧をめざすあまり更新が遅くなったり、満足いくものが書けずに更新しないことが多くなりがちです。そうなっては価値も薄れるので、とりあえず内容の至らなさを恐れずに、できるたけ更新していくことにします。

まずは、1/11〜13に石川県で開催される「染色体ワークショップ」に参加します。今年はなんと言っても柳田充弘先生の特別講演があり、楽しみです。

インドの街を歩く（１）

毎度遅れての海外レポートです。今回は11月初旬にいってきたインド・ケララ州でのHFSP meetingの話の続きです。

学会が全行程を終えたのは深夜でした。シンガポール経由で日本に帰国するわけですが、ティルバナンタプーラム（トリヴァンドラム）発シンガポール行きの飛行機はその日は飛んでおらず（週2便）、出発するのは翌日の深夜。身動きが取れずに、とりあえずその日は普通にホテルに泊まります。

翌日も、フライトのある深夜までおよそ10時間という長い空き時間が生じました。共同研究者たちは欧州行きの便なので、朝にホテルを出てしまいます。その後、深夜までの待ち時間をどうつぶすか考えた末、せっかくだからとインド観光に出かけました。

私が思い立ったのはHFSPが公式に手配したインド観光ツアーが出発した後だったので、タクシーに一人乗り込み、Kovalam Beach Hotelから一気にインド最南端のカニャクマリを目指しました。「片道2.5時間だよ」と言われ、それなら往復5時間で、帰りのフライトにちょうどいいと考えたのです。この日の夜に空港で日本人研究者に再会したときには「いや、それはむちゃくちゃ勇気ありますねぇ、、、」と驚かれました。私はそのとき全然不安がなかったんですが。

なにしろ物価が安いから、タクシーを一日雇ってもチップ込みで6,000円未満。ただし安全は保証されていないので、海外旅行保険には加入しておいたほうがいいですね。

まず、車窓から見る「観光地ではない」インドの町並みはすごく面白かったです。学会会場はすべてが完璧にととのえられた本当にオアシスのようなリゾート地でした。それに比べてタクシーの車窓から見る素のインドの光景は、、、私の勝手なイメージですが日本の終戦直後か昭和20年代のイメージに近いと感じました。人々の服装もとてもきれいとはいえず、道路も最低限の間に合わせの舗装で道ばたは土埃が舞い、牛やヤギ、犬が寝そべっている。民家や商店はぐちゃぐちゃに建ち並び、ドアもなく屋根も傾き今にも崩れ落ちそう、でもそこで売っているのは欧米日本のものと遜色ない最新の携帯電話。

上下水道なんかまったく整備されてないように見えるのに、携帯電話網は異常なまでに整備されてます。山の中でも携帯電話に使う回線を土中に埋める工事をよくしてました。そのおかげで、どんな田舎でも私のiPhoneは的確にAirtelやVodafone Indiaの電波をキャッチできました（ちなみにSofabankの海外パケット使い放題）。

道中出会った村のいくつかはtaxi driverの言葉を借りればpoor villageだそうで、そのような文明があるのかどうか分からないようなぼろぼろな貧しい田舎の村に行っても東大事務からのメールが読める。ここは人々の生活が原始的なのか文明的なのかものすごい違和感があります。なんとなく、「20世紀少年」の新旧がまざったようなヘンな文明社会。

これなんか、どないやねん、っていう感じの不気味さ。こんなのが普通にごろごろ転がっている町並み。もちろん自分以外の外国人観光客なんかいないので、これらは観光ではなく地元民のための施設ですよ。

次回はそこから続けます。

JST菊地俊郎さんの本について（２）

昨日書いたJSTの菊地参事の本「院生・ポスドクのための研究人生 サバイバルガイド」ですが、もう少しだけ内容を書きます。

この本には、

(1) 研究者が大学院を出てから先、どういう就職先や身分があるのか。現在の状況と今後の情勢。

(2) 研究するにあたり不可欠である研究費。どのような仕組みになっているのか。最新情報を交えてまとめてある。

(3) 研究者として独創的であるためにはどうしたらよいのか。独創的な発想をするためのヒントと、研究費獲得のための具体的なアドバイス。

について書かれています。

なかなか踏み込んだ内容ですね。しかし、マスコミ記事にありがちな、日本が理系研究について抱えている問題を批判して過剰な不安をあおるような無責任で非建設的な内容ではありません。菊地さんの本は「ガイド」と銘打っているように、日本や世界の現状を踏まえて、そのなかでどのように「自分がやりたい研究」を推進していくのか、というポジティブな議論です。

菊地さんと直接お話しして感じるのは常にポジティブであるということです。私はこれはとても重要なことであると考えます。その菊地さんの人柄がぎゅっと詰まった一冊になっていると実感します。

（注）私は菊地さんから宣伝を頼まれているわけではありません（笑）